新疆特殊的自然环境条件，决定了新疆绿色食品，尤其是园艺生产的瓜果品质优良，风味独特，优于其它省区。通过对新疆绿色食品原料基地的水质、土壤、大气的实地环境监测，结果表明：优质的农产品多来源于远离城镇的绿洲，自然生态环境较封闭，人为环境污染相对较小，土壤中各种微量元素的含量均在土壤背景值范围内（标准值±２Ｓ）；绿洲的水源依赖于天山、阿尔泰山和昆仑山冰雪融水和山区降水补给，水质清洁、矿化度较低。